Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AL390036.1-202ENST00000634635 2439 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms