Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 RPL7-203ENST00000396466 762 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 RPL4P5-201ENST00000413888 1276 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AL157402.1-201ENST00000429469 363 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 IQCF4-204ENST00000433169 414 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AC114755.4-201ENST00000439114 443 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 BX470209.2-201ENST00000442086 928 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 MPTX1-201ENST00000480235 609 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AL590867.2-201ENST00000492974 447 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 RN7SL62P-201ENST00000498506 297 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AC034207.1-201ENST00000506742 948 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AC108865.1-201ENST00000507644 496 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 IGKV3-25-201ENST00000523155 253 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 SRSF5-209ENST00000555349 565 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AC138512.1-201ENST00000563190 434 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 SSH2-209ENST00000579954 428 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 LGALS9DP-201ENST00000580112 764 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AC023855.1-201ENST00000585899 359 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 NDUFA3P1-201ENST00000588007 252 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 MKNK2-211ENST00000591142 875 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 BX510359.8-201ENST00000617713 296 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 GDNF-AS1-205ENST00000637926 3819 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 SIN3A-201ENST00000360439 5050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 GAPVD1-219ENST00000495955 5309 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 LINC00284-202ENST00000439707 2521 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 RBFOX1-201ENST00000311745 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 IL2RB-201ENST00000216223 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 ITGA6-206ENST00000442250 3393 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 DENND2A-208ENST00000492720 3614 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 GINS4-209ENST00000523277 3873 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 ZNF304-201ENST00000282286 4202 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 ABCA8-203ENST00000430352 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 CSNK1G1-201ENST00000303052 8179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 PPM1A-201ENST00000325642 1713 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 ZEB2-201ENST00000303660 3913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 CIT-201ENST00000261833 8578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 BLOC1S6-201ENST00000220531 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AC036108.3-201ENST00000564527 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 SLC16A4-206ENST00000472422 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 BBS9-202ENST00000350941 3899 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 ZNF343-201ENST00000278772 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 ZNF317-202ENST00000360385 3955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 ENTPD1-203ENST00000371207 1903 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 MAGEB4-201ENST00000378982 2142 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 DCLK1-202ENST00000360631 8007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 CACNB2-209ENST00000396576 4464 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 RUFY3-204ENST00000502653 2342 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 RNU1-120P-201ENST00000363009 157 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 MAS1L-201ENST00000377127 1260 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 IGLV1-51-201ENST00000390290 389 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 TRBV27-201ENST00000390399 387 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 CES5AP1-201ENST00000400418 859 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AC006450.2-201ENST00000429482 581 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 RPL12P14-201ENST00000431782 490 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AL354761.1-201ENST00000434190 526 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AC005588.1-201ENST00000439168 162 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 RN7SL263P-201ENST00000467969 290 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 FLT1-205ENST00000543394 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 BANF2-205ENST00000545418 360 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 OR1P1-201ENST00000571766 994 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AC093330.1-204ENST00000582763 396 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms