Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms