Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 IGKV6D-41-201ENST00000390271 371 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 RN7SKP117-201ENST00000410175 264 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 AL161742.1-201ENST00000418154 584 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 AC003035.2-201ENST00000448948 696 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 AL117382.2-201ENST00000455642 403 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 AC018980.1-201ENST00000457848 862 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 AP001994.1-201ENST00000527539 826 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 AP002004.1-206ENST00000532441 876 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 ZNF415-218ENST00000599261 601 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 AL031429.2-201ENST00000602605 649 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 AC244100.1-201ENST00000618141 407 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 AC006453.3-201ENST00000635891 377 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 OR10R2-202ENST00000641067 1132 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 OR10R2-203ENST00000641400 975 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 OR4F21-201ENST00000320901 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 UNC50-203ENST00000409347 1276 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 SLC25A24P1-202ENST00000434803 1220 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 AP003467.1-201ENST00000517397 301 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 VPS37A-208ENST00000521005 479 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB9P28065 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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