Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 AC091304.1-202ENST00000568624 3100 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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NFKB1P19838 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 Y_RNA.209-201ENST00000364156 111 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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NFKB1P19838 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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NFKB1P19838 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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NFKB1P19838 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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NFKB1P19838 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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NFKB1P19838 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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NFKB1P19838 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
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NFKB1P19838 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
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NFKB1P19838 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
NFKB1P19838 NUP210L-202ENST00000368553 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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NFKB1P19838 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
NFKB1P19838 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
NFKB1P19838 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
NFKB1P19838 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
NFKB1P19838 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
NFKB1P19838 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
NFKB1P19838 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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