Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
MTSS1O43312 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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