Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 AC111186.1-201ENST00000604684 130 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RFXAPO00287 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 FAM71F1-207ENST00000485070 1574 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 AC244100.3-202ENST00000617328 1721 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 TRIM5-202ENST00000380034 2991 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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RFXAPO00287 NRIR-201ENST00000366140 799 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 C1orf162-202ENST00000369718 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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RFXAPO00287 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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RFXAPO00287 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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RFXAPO00287 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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RFXAPO00287 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 BEST3-212ENST00000553096 2929 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 TSHZ2-201ENST00000329613 3093 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
RFXAPO00287 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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