Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 pRNA.9-201ENST00000618609 89 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 PRND-201ENST00000305817 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 RAB27B-201ENST00000262094 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 CEP97-206ENST00000494050 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 MED21-201ENST00000282892 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 LRRC8B-203ENST00000439853 7474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 DDX42-203ENST00000457800 3323 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 OR4K1-201ENST00000285600 1076 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 FAM205C-201ENST00000340783 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AC015969.1-201ENST00000366218 1416 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 RAET1G-201ENST00000367360 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 LELP1-201ENST00000368747 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 PPIL1P1-201ENST00000423936 499 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AC009303.1-201ENST00000426307 352 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 RN7SL688P-201ENST00000471754 275 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AL049697.1-201ENST00000507897 2301 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AC016559.1-201ENST00000511420 199 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AC113423.2-201ENST00000517582 545 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 RPSAP66-201ENST00000592196 606 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AC024451.4-201ENST00000602578 752 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 FAM205C-203ENST00000603640 1017 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AP005328.2-201ENST00000606879 657 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 FRG2MP-201ENST00000613317 856 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AC243571.1-201ENST00000615743 478 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 USP47-203ENST00000399455 7396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AP002001.1-202ENST00000525797 1754 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 LINC01128-205ENST00000445118 6606 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 KIAA0100-201ENST00000389003 6852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 OR51M1-203ENST00000642046 4092 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 C1D-202ENST00000407324 1379 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 KCNN3-201ENST00000271915 13033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.6 ms