Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 ELMO1-AS1-201ENST00000419535 528 ntTSL 4 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC068647.2-202ENST00000485020 390 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 PABPC1P1-201ENST00000506347 591 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC084026.1-201ENST00000522028 564 ntTSL 4 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 OFCC1-218ENST00000622909 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC007938.1-201ENST00000562524 2902 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC087430.1-201ENST00000451707 3699 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 EPS8-213ENST00000543612 2965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 FOLH1-213ENST00000533034 2225 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AKAP13-203ENST00000394518 13215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 MUC21-201ENST00000376296 3651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 ERBB4-205ENST00000436443 12084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 NUMB-217ENST00000555738 1553 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 RNASEL-201ENST00000367559 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 OR4Q2-201ENST00000541415 2778 ntAPPRIS P5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 CIITA-201ENST00000324288 11952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 EBF1-203ENST00000517373 2277 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 KLHL32-207ENST00000620278 2642 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC108676.1-201ENST00000455557 2969 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 DCX-208ENST00000636035 9269 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AL022068.1-201ENST00000636202 1875 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 KLHL5-203ENST00000381930 3288 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC068535.1-201ENST00000416008 471 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 LINC01728-201ENST00000428529 524 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AP006587.5-201ENST00000532033 739 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms