Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 PLGLB1-202ENST00000409310 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL513164.1-201ENST00000423268 311 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC009303.1-201ENST00000426307 352 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RPS12P20-201ENST00000464109 380 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC104825.1-201ENST00000503186 685 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 CIPC-206ENST00000555611 599 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL353807.4-201ENST00000604995 257 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 TUBBP10-201ENST00000427668 1301 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 OR10A4-201ENST00000379829 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP30-201ENST00000411373 334 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 LINC01762-205ENST00000437308 539 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 WDR82P2-201ENST00000444540 928 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC092421.1-201ENST00000448148 418 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 LINC00349-201ENST00000448748 841 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC078788.2-201ENST00000462300 382 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 C8orf37-AS1-201ENST00000517437 456 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AP006437.1-202ENST00000530327 933 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 NF1P12-201ENST00000549593 583 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC092376.1-201ENST00000569677 335 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.1 ms