Protein–RNA interactions for Protein: Q86WS4

C12orf40, Uncharacterized protein C12orf40, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf40Q86WS4 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 SPATA31C2-201ENST00000324915 3777 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 CCDC129-203ENST00000409210 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 CLUL1-201ENST00000338387 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 AC018992.1-201ENST00000523778 2149 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 FAR2P1-201ENST00000325390 3679 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 EPHA6-204ENST00000502694 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 AL353651.1-201ENST00000415629 355 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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C12orf40Q86WS4 AC010148.1-201ENST00000427619 707 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 AC236972.4-201ENST00000458091 963 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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C12orf40Q86WS4 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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C12orf40Q86WS4 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 AC008691.1-202ENST00000521472 811 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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C12orf40Q86WS4 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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C12orf40Q86WS4 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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C12orf40Q86WS4 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 FDFT1-208ENST00000525777 1472 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
C12orf40Q86WS4 CCDC129-205ENST00000451887 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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C12orf40Q86WS4 CDY2A-202ENST00000426790 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
C12orf40Q86WS4 CDY2B-202ENST00000544303 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
C12orf40Q86WS4 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
C12orf40Q86WS4 SYCP1-202ENST00000369522 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
C12orf40Q86WS4 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
C12orf40Q86WS4 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
C12orf40Q86WS4 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
C12orf40Q86WS4 IL1RAP-213ENST00000447382 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
C12orf40Q86WS4 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
C12orf40Q86WS4 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
C12orf40Q86WS4 RAB2B-201ENST00000397762 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
C12orf40Q86WS4 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
C12orf40Q86WS4 TMEM200A-203ENST00000545622 2918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
C12orf40Q86WS4 AL034417.4-202ENST00000642135 2236 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
C12orf40Q86WS4 FGF9-201ENST00000382353 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
C12orf40Q86WS4 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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