Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCF23Q7RTU1 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCF23Q7RTU1 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms