Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 FANCD2OS-206ENST00000524279 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 CD59-208ENST00000527577 686 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 ASB8-211ENST00000539528 839 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC131157.1-201ENST00000547902 722 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC106788.1-202ENST00000548889 1212 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 TRIM69-210ENST00000561043 1017 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC007218.1-201ENST00000561538 660 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 DNM1P31-201ENST00000564149 696 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 ULK4P2-202ENST00000564187 492 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 ANP32BP1-201ENST00000564205 1297 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC233702.4-201ENST00000581610 304 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 ZNF223-202ENST00000585552 541 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 PHBP20-201ENST00000603694 818 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 MGST2-207ENST00000616265 1278 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC073254.1-206ENST00000617813 907 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 NPPA-AS1_1.1-201ENST00000622391 173 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 OR1B1-201ENST00000623530 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AK2-214ENST00000626911 160 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 ZNF410-225ENST00000639051 936 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 CYCS-201ENST00000305786 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 ZNF10-201ENST00000248211 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 METTL14-201ENST00000388822 6669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC015849.5-201ENST00000604907 5473 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 2102 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 ZNF562-208ENST00000590155 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC138915.4-201ENST00000565549 4147 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 DCTN2-202ENST00000543672 1321 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL157895.1-201ENST00000451713 1404 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 KIDINS220-202ENST00000319688 3765 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 CPB1-208ENST00000491148 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 METTL18-202ENST00000310392 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 PRC1-AS1-201ENST00000554388 1525 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 MIR210-201ENST00000362168 110 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 ZNF669-203ENST00000366501 730 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 CRABP2-202ENST00000368221 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 TRDV2-201ENST00000390469 520 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL353692.1-201ENST00000405081 755 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 SOX2OT_exon3.1-201ENST00000410534 276 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC245517.3-201ENST00000440562 250 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 CD59-206ENST00000445143 825 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC010982.1-201ENST00000450325 465 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL591438.2-201ENST00000452635 691 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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