Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AL162427.1-201ENST00000450399 439 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FSCN1Q16658 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms