Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 SPAG11B-201ENST00000297498 795 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 RPL7-201ENST00000352983 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 RNA5SP355-201ENST00000365317 135 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 MYL6P3-201ENST00000436904 432 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 GOT2P2-201ENST00000450663 1251 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 LECT2-203ENST00000512872 762 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 SMIM20-202ENST00000514384 774 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 IGLC4-201ENST00000517690 248 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 RPS27AP19-201ENST00000597285 458 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 CYP2C8-213ENST00000628935 924 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 KYNUP2-201ENST00000582280 1329 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 KCNN3-201ENST00000271915 13033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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ECM1Q16610 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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ECM1Q16610 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
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ECM1Q16610 MRPS18C-201ENST00000295491 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AP000812.1-201ENST00000378140 477 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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ECM1Q16610 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AL356133.1-201ENST00000444762 372 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AL157400.2-201ENST00000454174 563 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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ECM1Q16610 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC105150.1-201ENST00000518011 551 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC099805.1-205ENST00000521794 837 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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