Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 TPT1-AS1-209ENST00000520585 818 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 BBOF1-202ENST00000463558 550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC113191.1-201ENST00000517759 403 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC084851.2-201ENST00000530377 364 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 BMS1P16-201ENST00000556075 1147 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
USF2Q15853 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms