Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 ZNF793-207ENST00000587986 3869 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 SAMMSON-222ENST00000641901 2727 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 CSN2-201ENST00000353151 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 TRBV25-1-202ENST00000390398 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 SMIM2-201ENST00000400419 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 OSTN-AS1-201ENST00000430375 515 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 Z83313.1-201ENST00000433780 718 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 IGKV1OR2-2-201ENST00000451163 355 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 SEC62-AS1-201ENST00000479626 346 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 RPL32P3-203ENST00000506593 498 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC018992.1-201ENST00000523778 2149 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC060809.1-201ENST00000559211 564 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC068418.1-201ENST00000582990 404 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC011933.4-201ENST00000585081 403 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC130456.6-201ENST00000623745 765 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 MIR7515HG-257ENST00000625915 852 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC119674.1-201ENST00000641611 1210 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 CTAGE1-201ENST00000391403 4313 ntAPPRIS P2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 TMEM230-204ENST00000379277 1536 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 NASP-203ENST00000372052 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 TCAM1P-205ENST00000478379 3317 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 SLC13A1-204ENST00000539873 2222 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AL031594.1-201ENST00000417123 1932 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AL359922.2-201ENST00000581788 3017 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 GTF2IRD2P1-201ENST00000449689 2749 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 PLXNC1-205ENST00000547057 2455 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 ARHGAP42P5-201ENST00000548856 2936 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 SCML1-203ENST00000380045 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 LIX1L-AS1-203ENST00000421764 287 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AL359076.1-201ENST00000426860 420 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
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