Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AL357153.1-201ENST00000500016 2941 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PCM1Q15154 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms