Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC025419.1-203ENST00000540652 726 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 PRL-202ENST00000615510 1268 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
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BRD3Q15059 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
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BRD3Q15059 E2F6P3-201ENST00000441743 743 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
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BRD3Q15059 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
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BRD3Q15059 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
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BRD3Q15059 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
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BRD3Q15059 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC126323.5-201ENST00000569913 592 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 DIMT1P1-201ENST00000603970 763 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC022001.1-201ENST00000605193 268 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 CALB1-208ENST00000518457 1490 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
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