Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB39AQ14964 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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RAB39AQ14964 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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RAB39AQ14964 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RAB39AQ14964 FABP3-201ENST00000373713 725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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