Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 BCAS2P1-201ENST00000528022 632 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RPS29P62273 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms