Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms