Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 IGF1R-206ENST00000558762 11726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 TIMM21-204ENST00000580087 2524 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 TEKT1-201ENST00000338694 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 UBAP2L-203ENST00000361546 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 NLGN4X-201ENST00000275857 5454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 TMEM217-201ENST00000336655 1546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 RND3-202ENST00000375734 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 AL353795.1-201ENST00000439134 1775 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC7□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 LOXHD1-201ENST00000300591 3970 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 LINC02208-201ENST00000506769 2803 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 DSCAM-203ENST00000617870 6176 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 ANKS1B-211ENST00000547776 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 SLC4A4-203ENST00000351898 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 KCNMB2-201ENST00000358316 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 SRCAP-201ENST00000262518 11754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 LINC01588-202ENST00000528300 3208 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 CPA4-201ENST00000222482 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 LINC02312-201ENST00000555187 3046 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 SOX6-211ENST00000528429 2656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 AC114776.1-201ENST00000414159 4395 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 C4BPA-201ENST00000367070 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 SPHKAP-202ENST00000392056 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 OR6N2-201ENST00000339258 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 AC005040.1-201ENST00000437783 482 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 AC108688.1-201ENST00000485817 713 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 RPL41-202ENST00000501597 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 TECRP2-201ENST00000503270 928 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 NACAP6-201ENST00000509572 622 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 RPS7P1-201ENST00000571702 585 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 AC133041.1-201ENST00000608389 201 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 AC004448.4-210ENST00000610229 833 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 AL031777.2-201ENST00000611953 196 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 AC012629.3-201ENST00000623397 328 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 PDAP1-205ENST00000626285 120 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 SLC39A12-203ENST00000377374 2639 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 CD109-203ENST00000437994 9401 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 CORO1C-202ENST00000420959 3921 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 REG4-203ENST00000369401 2327 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 CWF19L1-201ENST00000354105 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 LINC01994-201ENST00000496220 1808 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 ADGRA3-209ENST00000508133 1572 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 AMPD3-204ENST00000444303 3994 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 AC106886.5-201ENST00000380361 11692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 STON2-209ENST00000614646 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 MFSD6-201ENST00000281416 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 VWA5A-205ENST00000456829 4388 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 RIPOR2-208ENST00000613507 5539 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 ZHX3-201ENST00000309060 10030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 GTPBP10-202ENST00000257659 1740 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 LMO7-207ENST00000465261 5580 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 AC009108.3-201ENST00000602739 3515 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
C9orf172C9J069 PHF11-201ENST00000357596 1471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms