Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HMGB1P1B2RPK0 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HMGB1P1B2RPK0 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HMGB1P1B2RPK0 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HMGB1P1B2RPK0 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HMGB1P1B2RPK0 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HMGB1P1B2RPK0 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HMGB1P1B2RPK0 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HMGB1P1B2RPK0 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HMGB1P1B2RPK0 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.4
HMGB1P1B2RPK0 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 PDE4D-210ENST00000503258 2860 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 ADK-201ENST00000286621 1169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 NPL-202ENST00000367552 745 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 PDCL3P5-201ENST00000398028 722 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC015987.1-201ENST00000419211 804 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC118470.1-201ENST00000419891 453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC011410.1-201ENST00000524175 705 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 CMC2-213ENST00000565914 528 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 LINC01892-201ENST00000579141 507 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 PTPRD-AS1-201ENST00000430766 1959 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 RPS6KA6-201ENST00000262752 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AL596451.1-201ENST00000419824 572 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 ETDB-201ENST00000423661 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 ETDB-202ENST00000426364 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 ETDA-202ENST00000454551 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 AC013356.3-201ENST00000558601 584 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 NR2F2-AS1-205ENST00000559505 1005 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
HMGB1P1B2RPK0 DNM1P47-201ENST00000560757 334 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms