Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms