Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 RDH11-203ENST00000553384 1926 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 PLEKHS1-203ENST00000369309 2534 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 NR1I3-202ENST00000367980 1403 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 MBNL3-203ENST00000370849 1444 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 CSNK2A3-201ENST00000528848 1416 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 MC2R-201ENST00000327606 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 MIR106B-201ENST00000385301 82 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 RFKP1-201ENST00000400940 428 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 CTSLP8-201ENST00000413075 967 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 AC012462.2-201ENST00000414756 391 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 AL390840.1-201ENST00000420303 988 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 AC073367.1-201ENST00000421480 697 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 RPL4P4-201ENST00000422486 1284 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 ZBTB8OSP2-201ENST00000423890 504 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 AC006017.1-201ENST00000424630 673 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 CEACAMP5-201ENST00000448037 961 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 HSD17B3-AS1-201ENST00000448857 1072 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 CASK-AS1-201ENST00000451126 515 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 AC040975.1-201ENST00000472104 316 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 AC015820.1-201ENST00000473882 321 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 PABPC1P1-201ENST00000506347 591 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 C4orf19-203ENST00000508175 828 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 OSTC-204ENST00000512478 663 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 AC027801.3-201ENST00000515049 698 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 ST13P6-201ENST00000522430 1102 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 AC009869.1-201ENST00000530418 528 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 AC025252.2-201ENST00000537470 502 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 BMS1P15-201ENST00000554269 1141 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 AL132712.1-201ENST00000555967 582 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 AC008870.2-201ENST00000568262 1024 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 AC133565.1-201ENST00000569218 488 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 AC061975.4-201ENST00000578466 776 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 AC003002.3-201ENST00000597410 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 CARSP1-201ENST00000603171 889 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 CCL14-202ENST00000618404 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 AL132796.3-201ENST00000624703 900 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 AC022743.1-201ENST00000624990 664 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 MIR7515HG-257ENST00000625915 852 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 SNORA43.5-201ENST00000631270 138 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 BCAS3-234ENST00000639611 108 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 CASC19-232ENST00000641480 1244 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 VNN3-202ENST00000367927 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 OR52K3P-202ENST00000641797 1729 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 AURKA-206ENST00000395913 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 CD160-205ENST00000616463 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 SLC16A4-202ENST00000369781 2082 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 ANKRD30A-205ENST00000611781 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 METTL18-202ENST00000310392 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 MT-CO1-201ENST00000361624 1542 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 AC009264.1-207ENST00000425981 1538 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
C8orf49Q96NF6 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms