Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PLD3Q8IV08 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PLD3Q8IV08 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms