Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms