Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
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CCDC142Q17RM4 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
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CCDC142Q17RM4 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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CCDC142Q17RM4 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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CCDC142Q17RM4 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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CCDC142Q17RM4 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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CCDC142Q17RM4 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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CCDC142Q17RM4 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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CCDC142Q17RM4 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
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