Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ECM1Q16610 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 PROX1-201ENST00000261454 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AQP4-205ENST00000581374 1586 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 PPP2R2B-202ENST00000394409 10704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
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ECM1Q16610 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 NAT1-206ENST00000518029 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 GLRA3-201ENST00000274093 8770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 ENSA-207ENST00000362052 703 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 FABP3-201ENST00000373713 725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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ECM1Q16610 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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ECM1Q16610 TMEM135-202ENST00000340353 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 OR51M1-203ENST00000642046 4092 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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ECM1Q16610 CENPL-203ENST00000367710 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 GPR89A-203ENST00000462900 1527 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 PRND-201ENST00000305817 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AL590542.1-201ENST00000449314 1596 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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