Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 RUFY2-201ENST00000265865 2033 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AC018639.1-201ENST00000492994 442 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.1 ms