Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AL034408.1-201ENST00000637712 664 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 CCR9-201ENST00000355983 2653 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AL359551.1-201ENST00000442726 2900 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 FLJ42393-201ENST00000623801 2270 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 TBC1D23-205ENST00000475134 2074 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 KPNA1-201ENST00000344337 6830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms