Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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COL4A6Q14031 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
COL4A6Q14031 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
COL4A6Q14031 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
COL4A6Q14031 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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COL4A6Q14031 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
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COL4A6Q14031 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
COL4A6Q14031 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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