Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC8.07□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC8.05□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.7 ms