Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AL355581.1-201ENST00000415964 830 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CBFBQ13951 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms