Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 MGC27382-202ENST00000436742 1993 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 NHS-204ENST00000615422 8860 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 GPC3-204ENST00000631057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 ARHGEF11-202ENST00000368194 6889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 MOV10-202ENST00000369644 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 GPN1-202ENST00000407583 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 MEP1B-201ENST00000269202 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 UBA1-203ENST00000377351 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 CEP192-202ENST00000430049 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 UBXN10-201ENST00000375099 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 SLC25A14-215ENST00000612248 1734 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 PIEZO2-201ENST00000302079 9356 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 LINC01344-203ENST00000608183 2631 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 CAPN3-201ENST00000318023 3172 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 PHACTR1-201ENST00000332995 5332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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MKRN4PQ13434 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AL022332.1-201ENST00000411511 428 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AL139135.1-201ENST00000412675 209 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 RPE-207ENST00000435437 858 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 LINC00444-201ENST00000435617 215 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AC007790.1-201ENST00000439081 782 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 RPL35P4-201ENST00000446039 322 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 RPL19P13-201ENST00000483119 583 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 OCIAD1-210ENST00000506801 571 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 RNU4ATAC12P-201ENST00000516460 113 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AC010768.2-201ENST00000532524 567 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AC087241.3-201ENST00000542076 862 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AC027288.3-203ENST00000553165 448 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 LINGO1-AS1-203ENST00000560265 335 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 LINC00595-215ENST00000635422 651 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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MKRN4PQ13434 PEX5L-209ENST00000468741 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 LINC02028-202ENST00000432154 2666 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 LRRC27-204ENST00000368614 6374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 SUN1-203ENST00000401592 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 FIGNL1-206ENST00000433017 3626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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MKRN4PQ13434 GOSR2-220ENST00000638838 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 ECD-203ENST00000430082 2246 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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MKRN4PQ13434 MAPK8-205ENST00000374182 5638 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 DUSP3-201ENST00000226004 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AC138869.3-201ENST00000563960 2486 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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MKRN4PQ13434 CHRM2-202ENST00000401861 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 CDC27-204ENST00000527547 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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MKRN4PQ13434 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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MKRN4PQ13434 RN7SL845P-201ENST00000484385 290 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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MKRN4PQ13434 AMTN-202ENST00000504451 761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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MKRN4PQ13434 AC024022.1-203ENST00000515392 478 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 ST3GAL3-237ENST00000533933 834 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 PGA4-202ENST00000537932 840 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 PGA3-204ENST00000538258 867 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 PGA4-206ENST00000544899 867 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AC009139.1-201ENST00000561672 652 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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