Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
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FOXC1Q12948 CCDC148-AS1-201ENST00000412781 795 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 AL035045.1-201ENST00000425405 632 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
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FOXC1Q12948 AL604028.2-201ENST00000437848 788 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
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