Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 FO082842.1-201ENST00000423552 1370 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 CCR2-204ENST00000445132 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
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