Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CENPFP49454 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CENPFP49454 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CENPFP49454 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CENPFP49454 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CENPFP49454 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CENPFP49454 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CENPFP49454 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CENPFP49454 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CENPFP49454 RAPGEF5-212ENST00000620335 5506 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CENPFP49454 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CENPFP49454 ATXN1-201ENST00000244769 10602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CENPFP49454 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CENPFP49454 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CENPFP49454 NAV2-213ENST00000533917 5084 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CENPFP49454 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CENPFP49454 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CENPFP49454 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CENPFP49454 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CENPFP49454 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CENPFP49454 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CENPFP49454 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CENPFP49454 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CENPFP49454 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CENPFP49454 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CENPFP49454 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CENPFP49454 UTY-202ENST00000331397 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CENPFP49454 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CENPFP49454 JADE1-203ENST00000452328 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CENPFP49454 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CENPFP49454 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CENPFP49454 OIP5-AS1-201ENST00000500949 8829 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CENPFP49454 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CENPFP49454 SPTAN1-202ENST00000372731 7889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CENPFP49454 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CENPFP49454 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CENPFP49454 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CENPFP49454 ZEB2-234ENST00000636413 8984 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CENPFP49454 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CENPFP49454 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CENPFP49454 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CENPFP49454 NAV1-202ENST00000367296 13091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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CENPFP49454 PTPRT-205ENST00000373193 12681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
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CENPFP49454 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CENPFP49454 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CENPFP49454 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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CENPFP49454 AC105046.1-201ENST00000566457 4997 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CENPFP49454 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
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CENPFP49454 PAICS-207ENST00000512576 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
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CENPFP49454 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CENPFP49454 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
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CENPFP49454 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CENPFP49454 PCSK1-201ENST00000311106 5086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CENPFP49454 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CENPFP49454 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CENPFP49454 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CENPFP49454 NRP1-206ENST00000374867 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CENPFP49454 ARHGEF11-202ENST00000368194 6889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CENPFP49454 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
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CENPFP49454 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CENPFP49454 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CENPFP49454 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CENPFP49454 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CENPFP49454 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CENPFP49454 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CENPFP49454 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CENPFP49454 AC013268.3-201ENST00000262716 2324 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CENPFP49454 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CENPFP49454 ZNF229-204ENST00000614049 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CENPFP49454 MYT1L-202ENST00000399161 7063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CENPFP49454 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CENPFP49454 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CENPFP49454 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
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