Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SH3BP1Q9Y3L3 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms