Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LHX3Q9UBR4 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LHX3Q9UBR4 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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