Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 MIR3159-201ENST00000584572 74 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 MIR6883-201ENST00000614952 78 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP96-201ENST00000516041 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC010326.3-201ENST00000597780 679 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 LINC02112-203ENST00000606169 419 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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