Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AC112203.1-201ENST00000506315 1020 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 RPL32P3-203ENST00000506593 498 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02121-201ENST00000507950 432 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC023794.3-204ENST00000510754 236 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02428-203ENST00000513793 438 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 RPL10P19-201ENST00000519013 301 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC022973.2-201ENST00000520146 549 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC087521.3-201ENST00000528226 553 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 ELK3-206ENST00000552142 1242 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 COPZ1-215ENST00000552362 575 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01588-211ENST00000556434 892 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 ULK4P2-202ENST00000564187 492 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC105275.2-201ENST00000567907 711 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC009121.2-201ENST00000572913 714 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC006547.1-208ENST00000598339 805 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AL451054.3-201ENST00000611115 776 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL820P-201ENST00000616437 299 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AL157359.3-201ENST00000623771 217 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC012560.1-201ENST00000634930 459 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AL139254.2-202ENST00000641937 1156 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 RNASE9-209ENST00000557068 2703 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 SPECC1L-207ENST00000541492 3525 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 UPP2-201ENST00000005756 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGAP42P4-201ENST00000549782 2934 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 UGT2B4-201ENST00000305107 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 DDX11L16-201ENST00000507418 1306 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 FMO5-203ENST00000441068 1696 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 NPL-212ENST00000614468 2376 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 ANK2-203ENST00000394537 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 CLCN3P1-202ENST00000609203 1944 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 ERVW-1-202ENST00000603053 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 PKP4-AS1-201ENST00000342892 4067 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 CA5B-201ENST00000318636 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 GLYAT-202ENST00000344743 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AL161725.1-201ENST00000591577 1351 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 ESRP1-203ENST00000433389 3770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 UTP23-201ENST00000309822 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 CTH-201ENST00000346806 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 MIR135B-201ENST00000362189 97 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 SPRR1A-201ENST00000368762 270 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 PPP1R7-204ENST00000402734 883 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 STAG3L1-201ENST00000404291 496 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 C1D-203ENST00000409302 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC117395.3-201ENST00000471176 680 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02024-203ENST00000496994 489 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC113208.1-201ENST00000497944 318 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 SLC22A10-203ENST00000526800 699 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AP003049.2-201ENST00000532992 540 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 TUBAP4-201ENST00000569261 416 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms