Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SEMA4CQ9C0C4 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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