Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 INTS7-203ENST00000366994 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 CLUL1-201ENST00000338387 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 JAM3-202ENST00000441717 3363 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 SLC14A2-203ENST00000586448 3540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 ZNF540-206ENST00000589117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 AMOT-202ENST00000371958 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 ADH4-212ENST00000629236 1974 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 NF1P8-201ENST00000415351 1461 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 ADGRL3-214ENST00000511324 5042 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 GRIK1-202ENST00000389124 2712 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 GRIA3-204ENST00000541091 2740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 PDCL3P5-201ENST00000398028 722 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 EEF1GP6-201ENST00000402309 905 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 MIR181A1HG-202ENST00000432296 930 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 GAPDHP53-201ENST00000458397 924 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 SNORA81.1-201ENST00000458922 177 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 RPL12P7-201ENST00000493832 494 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 AC113404.1-201ENST00000502589 756 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 RN7SKP233-201ENST00000517005 110 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 IGHVIII-25-1-201ENST00000522143 241 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 AC090193.1-202ENST00000524355 566 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 AL031846.1-201ENST00000560933 314 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 AC027801.5-201ENST00000574365 416 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 MIR5682-201ENST00000584864 76 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 FAM13A-AS1_2.1-201ENST00000611121 108 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 AC244100.1-201ENST00000618141 407 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 AL590065.1-201ENST00000603371 4774 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 MACROD2-203ENST00000402914 4425 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 TRIM49-201ENST00000329758 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 TRIM49C-201ENST00000448984 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 TRIM49B-202ENST00000622138 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 TMEM59-204ENST00000371344 2473 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 AC097634.1-201ENST00000604491 2467 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 MRPS27-202ENST00000457646 2628 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 NBPF3-202ENST00000318249 3591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 TP63-207ENST00000418709 2810 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 CNTNAP2-203ENST00000463592 6076 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 C8orf34-208ENST00000523686 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 AC079178.2-201ENST00000439323 1624 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 PPP3R2-201ENST00000374806 3387 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LPIN3Q9BQK8 RNF217-AS1-201ENST00000439075 4507 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms