Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AL138479.1-201ENST00000426913 484 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 CENPN-204ENST00000428963 971 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AL158214.1-201ENST00000444423 404 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AL450263.1-202ENST00000453199 643 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 GLYCTK-AS1-203ENST00000493616 445 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC025176.1-201ENST00000510261 365 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC027288.1-201ENST00000548359 816 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC010333.1-201ENST00000563116 563 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC024614.1-201ENST00000577546 307 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 MIR3159-201ENST00000584572 74 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC007785.3-202ENST00000601033 518 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 ZEB2-AS1-206ENST00000602006 572 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AL049541.2-201ENST00000626377 555 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 MED21-201ENST00000282892 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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UBXN4Q92575 AL121823.1-201ENST00000418369 741 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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UBXN4Q92575 HGF-206ENST00000444829 1184 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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UBXN4Q92575 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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UBXN4Q92575 OR7E163P-201ENST00000505943 894 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
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UBXN4Q92575 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC011410.1-201ENST00000524175 705 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AP002336.1-201ENST00000531426 422 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 TRIM69-204ENST00000558329 1211 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC022898.1-202ENST00000560864 806 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 SCIMP-204ENST00000574297 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 RN7SL689P-201ENST00000577215 297 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC005837.2-201ENST00000587459 479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 EIF1-207ENST00000591776 797 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 RPSAP66-201ENST00000592196 606 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
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