Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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ZNF548Q8NEK5 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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ZNF548Q8NEK5 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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