Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TTC29Q8NA56 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185 ms