Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 ZNF343-203ENST00000381253 819 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 CLIC4P3-201ENST00000422221 752 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 PHBP4-201ENST00000437447 837 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 LINC01832-201ENST00000446520 553 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 USP12-AS2-201ENST00000452222 279 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 DCN-215ENST00000550099 719 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 LINC01917-201ENST00000565170 1037 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 MIR4685-201ENST00000578185 69 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 CCL2-202ENST00000580907 736 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 EXOSC3P2-201ENST00000594464 497 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 S100B-203ENST00000397648 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 SNORA11D-201ENST00000408548 128 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 SNORA11E-201ENST00000408778 128 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL590095.1-201ENST00000420049 436 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL223P-201ENST00000470401 294 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC025271.1-201ENST00000485045 429 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL868P-201ENST00000485915 303 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC073896.2-202ENST00000549860 437 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
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