Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 SAMD8-201ENST00000372687 6935 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 ZMYND8-219ENST00000611941 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 DPH3-202ENST00000383775 3052 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 LINC01291-201ENST00000377469 3662 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 SSPO-201ENST00000378016 15589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 IL5RA-206ENST00000430514 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 ERC1-203ENST00000360905 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 ZNF234-204ENST00000592437 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 UBQLN3-201ENST00000311659 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 CTNND1-215ENST00000526938 3489 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 ABCC5-205ENST00000427120 4697 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 GON4L-219ENST00000622608 4801 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 DLC1-201ENST00000276297 7447 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 AL021396.1-202ENST00000457707 1929 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 PXYLP1-204ENST00000504264 1773 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 ABCA1-202ENST00000374736 10494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 ERCC4-201ENST00000311895 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 AL513523.1-201ENST00000417868 1309 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 SP4-201ENST00000222584 6126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 NUMA1-232ENST00000613205 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 PAX8-AS1-201ENST00000333145 2319 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 SLC24A1-211ENST00000544319 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 EYA3-201ENST00000373863 1729 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 STRADA-233ENST00000638888 1718 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 RXFP2-202ENST00000380314 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 CSNK2A1-201ENST00000217244 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 TRIM48-201ENST00000417545 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 SSR2-201ENST00000295702 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 COX6C-201ENST00000297564 433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 RNA5SP250-201ENST00000362534 119 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 AC009967.1-201ENST00000379462 793 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 RPS12P16-201ENST00000399739 407 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 AL137784.1-201ENST00000407121 745 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 AL589763.1-201ENST00000412257 791 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 HCG18-234ENST00000413358 916 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 RPSAP21-201ENST00000414293 885 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 EIF3IP1-201ENST00000433048 967 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 AL450311.1-201ENST00000434931 576 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 AL023584.1-201ENST00000437067 349 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 AC006463.1-201ENST00000445929 232 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 NBPF2P-201ENST00000453025 661 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 AC119424.1-201ENST00000472513 350 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 RN7SL563P-201ENST00000481233 298 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 AC022973.1-201ENST00000490340 575 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 IGKV1D-16-201ENST00000492446 378 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 JRKL-AS1-201ENST00000511243 426 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 COX6C-203ENST00000518171 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 PPFIBP2-216ENST00000530181 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 TPRXL-211ENST00000532880 754 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 AC007406.2-201ENST00000540868 503 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 AC093249.3-201ENST00000562444 424 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 AC009154.1-201ENST00000565822 508 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 AC004224.2-201ENST00000574423 529 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 RN7SL474P-201ENST00000583485 301 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 AC007336.2-201ENST00000611626 557 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 RBM22P6-201ENST00000611682 867 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 MIR6872-201ENST00000612981 62 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 FOLR2-210ENST00000619261 1126 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 AL031772.1-216ENST00000619494 697 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 CU639417.5-201ENST00000623983 476 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 RBMS3-AS2-207ENST00000629416 456 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 PHLPP2-206ENST00000568954 8317 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TREML4Q6UXN2 ZNF512-201ENST00000355467 3541 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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